In Pokémon Ranger: Ombre su Almia sono presenti sei missioni speciali, scaricabili dalla Ranger Net in un determinato periodo di tempo. Da ricordare che la Ranger Net è sbloccabile solo dopo aver completato la storia principale.
Salva l’Uovo di Manaphy!
- Pokémon protagonista: Manaphy (Uovo)
- Scopo della missione: Difendere l’Uovo di Manaphy dal Team Pesto Buio. L’Uovo sarà trasferibile nei giochi di IV Generazione.
- Disponibile in Giappone: Dal 20 marzo 2008 al 15 giugno 2008 e dal 1 dicembre 2008 al 15 gennaio 2009
- Disponibile in America: Dal 10 novembre 2008 al 31 gennaio 2009
- Disponibile in Europa: Dal 21 novembre 2008 al 14 febbraio 2009
Missione: Libera Riolu!
- Pokémon protagonista: Riolu
- Scopo della missione: Liberare Riolu dalle grinfie del Team Pesto Buio. Questo Riolu, che conosce Forzasfera, sarà trasferibile dei giochi di IV Generazione.
- Disponibile in Giappone: Dal 20 marzo 2008 al 15 giugno 2008 e dal 1 dicembre 2008 al 15 gennaio 2009
- Disponibile in America: Dal 10 novembre 2008 al 31 gennaio 2009
- Disponibile in Europa: Dal 21 novembre 2008 al 14 febbraio 2009
Missione: Libera la Torre!
- Pokémon protagonista: Darkrai
- Scopo della missione: Impedire che il Team Pesto Buio porti a compimento i suoi piani malefici e liberare Darkrai. Darkari sarà trasferibile nei giochi di IV Generazione.
- Disponibile in Giappone: Dal 26 aprile 2008 al 15 giugno 2008 e dal 1 dicembre 2008 al 15 gennaio 2009
- Disponibile in America: Dal 1 dicembre 2008 al 30 gennaio 2009
- Disponibile in Europa: Dal 1 dicembre 2008 al 30 gennaio 2009
Missione: Dialga nel Castello Almia?
- Pokémon protagonista: Dialga
- Scopo della missione: Riportare Dialga nella sua dimensione e placare la sua furia.
- Disponibile in Giappone: Dal 16 giugno 2008 al 19 maggio 2014
- Disponibile in America: Dal 5 gennaio 2009 al 19 maggio 2014
- Disponibile in Europa: Dal 12 gennaio 2009 al 19 maggio 2014
Missione: Palkia nel Deserto Haruba?
- Pokémon protagonista: Palkia
- Scopo della missione: Riportare Palkia nella sua dimensione e placare la sua furia per riportare alla normalità lo spazio.
- Disponibile in Giappone: Dal 16 giugno 2008 al 19 maggio 2014
- Disponibile in America: Dal 5 gennaio 2009 al 19 maggio 2014
- Disponibile in Europa: Dal 12 gennaio 2009 al 19 maggio 2014
Missione: Per la sposa e per Shaymin!
- Pokémon protagonista: Shaymin
- Scopo della missione: Proteggere Shaymin dal Team Pesto Buio.
- Disponibile in Giappone: Dal 19 luglio 2008 al 31 agosto 2008 e dal 1 dicembre 2008 al 15 gennaio 2009
- Disponibile in America: Dal 1 marzo 2009 al 30 aprile 2009
- Disponibile in Europa: Dal 1 al 31 marzo 2009