Sono presenti differenze e migliorie tra Rosso e Blu (Versione Europea) e Rosso, Blu e Verde (Versione Giapponese).
Versione Giapponese
La versione giapponese di Pokémon Versione Blu, rispetto alla Versione Rossa e Verde, presenta dei cambiamenti.
Alcuni elementi minori della regione di Kanto, quali finestre, porte e pannelli, hanno subito un aggiornamento.
La Grotta Celeste, celebre dimora del Pokémon leggendario Genetico Mewtwo, è stata completamente modificata.
Tali cambiamenti sono presenti anche nella versione Internazionale di Pokémon Versione Rossa e Pokémon Versione Blu.
Gli scambi che si possono effettuare con gli NPC durante l’avventura hanno diversi Pokémon e anche i premi del Casinò sono differenti.
L’introduzione, invece che mostrare la classica lotta tra Gengar e Nidorino, mostra invece una battaglia tra Gengar e Jigglypuff.
I Pokémon che nella Versione Rossa e Verde sono ottenibili solo tramite scambio, nella Versione Blu si possono catturare allo stato selvatico.
Versione Europea
Anche le versioni Internazionali di Pokémon Versione Rossa e Versione Blu presentano delle differenze rispetto agli originali giapponesi.
La grafica è leggermente migliorata, se si utilizza un Game Boy Color, lo scenario dei due giochi tenderà al colore della versione, ovvero o Rosso o Blu.
Sono stati introdotti gli scambi e le lotte tra due Game Boy, la novità che ha rivoluzionato completamente il panorama dei videogiochi.
