Differentemente dagli altri giochi, in Pokémon Puzzle Challenge c’è la possibilità di incontrare alcuni Pokémon senza poterli catturare. L’elenco dei Pokémon incontrati sarà visibile aprendo il Pokédex dal Menù e selezionando, successivamente, Dati Pokémon. Di seguito verrà presentata la lista completa dei Pokémon utilizzabili nel gioco e di quelli non utilizzabili.
Pokémon utilizzabili
| Pokémon | Come Ottenerlo |
|---|---|
| #152 Chikorita
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Sbloccabile all’inizio del gioco. |
| #155 Cyndaquil
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Sbloccabile all’inizio del gioco. |
| #158 Totodile
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Sbloccabile all’inizio del gioco. |
| #25 Pikachu
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Sbloccabile dopo aver sconfitto il Gentiluomo e dopo aver eseguito una combo da sei blocchi in Modalità Sfida. |
| #161 Sentret
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Sbloccabile dopo aver sconfitto la Bellezza e dopo aver eseguito una combo da sei blocchi in Modalità Sfida. |
| #172 Pichu
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Sbloccabile dopo aver sconfitto il Pokéfanatico e dopo aver giocato per più di quattro minuti prima di Sandra in Modalità Sfida. |
| #173 Cleffa
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Sbloccabile dopo la schiusura dell’uovo. |
| #174 Igglybuff
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Sbloccabile dopo la schiusura dell’uovo. |
| #175 Togepi
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Sbloccabile dopo aver sconfitto il Pokéfanatico e dopo aver eseguito una combo da sei blocchi in Modalità Sfida. |
| #182 Bellossom
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Sbloccabile dopo aver sconfitto la Pupa e dopo aver battuto un allenatore in meno di 25 secondi in Modalità Sfida. |
| #183 Marill
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Sbloccabile dopo aver sconfitto il Gentiluomo e dopo aver eseguito quattro allineamenti a catena in Modalità Sfida. |
| #239 Elekid
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Sbloccabile dopo la schiusura dell’uovo. |
| #240 Magby
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Sbloccabile dopo la schiusura dell’uovo. |
Pokémon non utilizzabili
| Pokémon | Come Sbloccarlo |
|---|---|
| #16 Pidgey
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Falkner in Modalità Sfida. |
| #14 Kakuna
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Bugsy in Modalità Sfida. |
| #35 Clefairy
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Whitney in Modalità Sfida. |
| #92 Gastly
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Morty in Modalità Sfida. |
| #56 Mankey
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Chuck in Modalità Sfida. |
| #208 Steelix
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Jasmine in Modalità Sfida. |
| #86 Seel
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Pryce in Modalità Sfida. |
| #148 Dragonair
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Clair in Modalità Sfida. |
| #124 Jynx
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Will in Modalità Sfida. |
| #169 Crobat
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Koga in Modalità Sfida. |
| #237 Hitmontop
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Bruno in Modalità Sfida. |
| #198 Murkrow
|
Sbloccabile dopo aver sconfitto Karen in Modalità Sfida. |
| #149 Dragonite
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Sbloccabile dopo aver sconfitto Lance in Modalità Sfida. |
