I livelli di Hey You, Pikachu! sono divisi in tre difficoltà.
Pikachu’s Discovery Days
La difficoltà iniziale, per i principianti. Selezionabile dalla porta nella camera del giocatore, è rappresentata da uno scarabocchio delle diverse ambientazioni del gioco.
La musica è un remix del tema di Pokémon Rosso e Blu, ed è l’unica difficoltà in cui possono essere affrontati tre livelli di pesca.
Le ambientazioni giocabili sono le seguenti:
- Viridian Forest
- Ochre Woods
- Ochre Fishing Spot
- Springleaf Field
- Cobalt Fishing Spot
- Olivine Fishing Spot
Pikachu’s Play Days
La difficoltà intermedia. Selezionabile dal cancello anteriore del cortile della casa del giocatore, ed è rappresentata da un disegno abbastanza dettagliato delle ambientazioni del gioco.
La musica è un remix tropicale del tema di Pokémon Rosso e Blu, e le ambientazioni giocabili sono le seguenti:
- Ochre Woods
- Springleaf Field
- Cobalt Coast
- Cobalt Island
- Olivine Lake
Pikachu’s Daring Days
La difficoltà maggiore, appare nel cancello laterale del cortile della casa del giocatore, ed è rappresentata da un disegno molto dettagliato di tutte le ambientazioni del gioco.
La musica è un remix orchestrale del tema di Pokémon Rosso e Blu, e un livello speciale può essere giocato pronunciandone il nome mentre si è sulla mappa. Le ambientazioni giocabili sono le seguenti:
- Viridian Forest
- Ochre Woods
- Springleaf Field
- Cobalt Island
- Olivine Lake
- Professor Oak’s Secret Training (Livello speciale)