Pokémon Mystery Dungeon WiiWare può usufruire dell’utilizzo di password per poter sbloccare alcuni Pokémon non ottenibili nel gioco e consente al giocatore di aggiungerli alla loro squadra. Di seguito l’elenco delle codici rilasciati:
| Password | Pokémon | Pokédex | Livello | Ottenuto tramite | Data di lancio |
|---|---|---|---|---|---|
| H%42 15NY MJ0% SYSH |  Manaphy |
490 | 7 | Manuale di Gioco | 04/08/2009 |
| RT#H XW#0 YRM= 5&@7 |  Chikorita |
152 | 5 | Sito ufficiale | 04/08/2009 |
| #8T& S65& 2X9W TN3T |  Porygon |
137 | 23 | Sito ufficiale | 04/08/2009 |
| 15HY N0KQ S=T0 T58% |  Heatran |
485 | 25 | Sito ufficiale | 07/08/2009 |
| WN-6 YC@5 -#27 2F%4 |  Dratini |
147 | 5 | Sito Yahoo | 11/08/2009 |
| WT29 J-+R CSC6 Q=7K |  Wailord |
321 | 40 | Sito Yahoo | 11/08/2009 |
| 6159 #4=% 14JW QNJ9 |  Gyarados
(Cromatico) |
130 | 30 | Canale Nintendo | 26/08/2009 |
| H@8% @40N -9=9 YH@M |  Lapras |
131 | 40 | Flyer | 01/09/2009 |
| 79-% 7YF1 R7KR R+@6 |  Budew
(Cromatico) |
406 | 5 | Flyer | 01/09/2009 |
| 6JCQ Y443 818J YW36 |  Hoppip
(Cromatico) |
187 | 5 | Pokémon Daisuki Club | 12/09/2009 |
| #X2W &44= JN99 5H@W |  Spiritomb |
442 | 40 | Famitsu DS & Wii di novembre | 29/09/2009 |
| %4YN M#05 =FP+ @9SQ |  Metagross |
376 | 45 | Nintendo DS Dengeki di novembre | 29/09/2009 |
| K-43 P@@0 0S-Y 7%KC |  Ludicolo |
272 | 45 | Pokémon Daisuki Club | 12/10/2009 |
| Y3Y= =@X@ W%H# =+-F |  Chimchar |
390 | 41 | Pokémon Sunday | 01/11/2009 |
| NK-M T&61 WJS@ +WX# |  Lucario |
448 | 51 | Pokémon Sunday | 08/11/2009 |
| P-3M +#FJ 80RY 44+9 |  Shiftry |
275 | 45 | Pokémon Daisuki Club | 12/11/2009 |
| #-F5 5N-% +P4S 5C#6 |  Sableye |
302 | 57 | Pokémon Sunday | 15/11/2009 |
| 4T2N JN#+ PJ81 5HC- |  Milotic |
350 | 40 | Canale Nintendo | 19/11/2009 |
| 5F9S 0F79 PJ81 5HC– |  Voltorb
(Cromatico) |
100 | 5 | Pokémon Sunday | 21/11/2009 |
| K–Q &X%R 1%MC =8TX |  Roserade
(Cromatico) |
407 | 50 | Pokémon Daisuki Club | 18/12/2009 |