Anche in Pokémon Cristallo sarà possibile catturare dei Pokémon leggendari. Di seguito troverete una lista completa di quelli ottenibili durante il proseguimento della vostra avventura.
| Pokémon | Livello | Tipo | Mosse | Luogo di cattura |
|---|---|---|---|---|
 Raikou |
40 |  |
Fulmisguardo, Tuonoshock, Boato, Attacco Rapido | In modo casuale durante il cammino verso Johto |
| Pokémon | Livello | Tipo | Mosse | Luogo di cattura |
|---|---|---|---|---|
 Entei |
40 |  |
Fulmisguardo, Braciere, Boato, Turbofuoco | In modo casuale durante il cammino verso Johto |
| Pokémon | Livello | Tipo | Mosse | Luogo di cattura |
|---|---|---|---|---|
 Suicune |
40 |  |
Fulmisguardo, Pistolacqua, Boato, Raffica | Johto, ma solo dopo aver parlato con Eugenius |
| Pokémon | Livello | Tipo | Mosse | Luogo di cattura |
|---|---|---|---|---|
 Lugia |
60 |   |
Ripresa, Idropompa, Pioggiadanza, Comete | Isole Vorticose, ma solo se dotati di Ala d’Argento (reperibile da un signore a Plumbeopoli dopo aver sconfitto i Superquattro) |
| Pokémon | Livello | Tipo | Mosse | Luogo di cattura |
|---|---|---|---|---|
 Ho-Oh |
60 | |
Ripresa, Fuocobomba, Giornodisole, Comete | Torre Campana, ma solo se dotati di Ala d’Iride (reperibile da Eugenius ad Azzurropoli dopo avergli mostrato i tre Cani leggendari) |
| Pokémon | Livello | Tipo | Mosse | Luogo di cattura |
|---|---|---|---|---|
 Celebi |
30 |  |
Ripresa, Salvaguardia, Forzantica, Divinazione | Bosco di Lecci, dopo essersi procurati la GS Ball collegando il gioco al proprio cellulare attraverso il Pokémon Mobile System GB |