Pare che il Pokémon leggendario Zygarde abbia lasciato Kalos per Alola: nel tentativo di scoprirne il motivo, Dexio e Sina, gli assistenti del Professor Platan già incontrati in Pokémon X e Pokémon Y, affideranno al giocatore il compito di trovare tutti gli elementi che lo compongono, raccogliendoli nella 
Teca Zygarde.
Le forme di Zygarde
Il Rigeneratron alla Base Æther del Percorso 16 permette di aggregare le cellule e i nuclei raccolti in giro per Alola per dare forma al potente Zygarde:
| Forma | Informazioni | Abilità |
|---|---|---|
 Zygarde Forma 10% |
È la forma che Zygarde assume quando è composto dal 10% delle cellule. I suoi PS sono la metà di quelli della Forma 50%, e più in generale le sue statistiche, ad eccezione della Velocità che è di gran lunga migliore, sono inferiori rispetto a quelle delle altre forme Se Zygarde Forma 10% ha l’abilità Sciamefusione, assume la Forma Perfetta quando i suoi PS scendono a metà o meno durante la lotta |
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 Zygarde Forma 50% |
Fino a poco tempo fa questa era l’unica forma nota di Zygarde, ma in realtà è costituita dal 50% delle sue cellule. Con l’abilità Sciamefusione può tramutarsi nella Forma Perfetta quando i suoi PS scendono a metà o meno durante la lotta |
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 Zygarde Forma Perfetta |
È la forma che Zygarde Forma 10% e Zygarde Forma 50% con l’abilità Sciamefusione assumono durante la lotta se i loro PS scendono a metà o meno. I PS di Zygarde Forma Perfetta sono il doppio di quelli della Forma 50% |
Sciamefusione |
La macchina consente anche il processo inverso, vale a dire scomporre uno Zygarde esistente nelle sue cellule e nei suoi nuclei.
Così facendo, tuttavia, mosse, esperienza e fiocchi acquisiti andranno persi.
Quando il giocatore avrà raccolto tutti gli elementi fra cellule e nuclei e usato il Rigeneratron per aggregare uno Zygarde che abbia l’abilità Sciamefusione, il giocatore potrà cambiargli forma usando la Teca Zygarde.
I Nuclei di Zygarde
I nuclei sono gli elementi meno numerosi, ma sono anche quelli che contengono le mosse da insegnare a Zygarde, tre delle quali caratteristiche del Pokémon Equilibrio.
Emanano un bagliore rosso e non si fanno trovare all’aperto: preferiscono luoghi più protetti, come le case dei Kahuna.
| Immagine | Isola | Luogo | Mossa insegnabile |
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Mele Mele | Percorso 1 – Periferia di Hau’oli Casa del giocatore |
Extrarapido |
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Mele Mele | Lili Casa di Hala |
Mille Frecce |
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Akala | Konikoni Casa di Alyxia |
Dragodanza |
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Ula Ula | Percorso 17 Stazione di polizia |
Mille Onde |
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Poni | Via Antica di Poni Casa di Hapi |
Nucleocastigo |
Le cellule di Zygarde
Sparpagliate per gran parte dei luoghi e dei Percorsi della regione, le cellule emanano un bagliore verde non sempre visibile: per raccoglierle tutte, pertanto, bisognerà tornare nei posti già esplorati in momenti diversi della giornata. Dei 95 elementi che comporranno Zygarde Forma Perfetta, se ne trovano:
- 14 a Mele Mele
- 18 ad Akala
- 30 a Ula Ula
- 28 a Poni
- 5 all’Æther Paradise
Mele Mele
| Immagine | Luogo | Condizioni |
|---|---|---|
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Baia Kala’e | – |
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Cimitero di Hau’oli | – |
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Grotta Sottobosco | – |
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Hau’oli – Zona Commerciale | Notte |
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Hau’oli – Zona Commerciale Casa di Liam (PT) |
– |
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Lili | Notte |
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Percorso 1 | Giorno |
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Percorso 1 | Giorno |
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Percorso 1 – Periferia di Hau’oli | – |
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Percorso 1 – Periferia di Hau’oli Scuola per Allenatori |
Notte |
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Percorso 2 | – |
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Percorso 3 | Giorno |
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Percorso 3 | – |
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Tempio del Conflitto | – |
Akala
| Immagine | Luogo | Condizioni |
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Fattoria Ohana | Giorno |
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Fattoria Ohana | Notte |
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Giungla Ombrosa – Grotta | |
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Kantai Seconda visita |
Notte |
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Kantai Hotel Voce del Mare |
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Konikoni | Notte |
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Parco del Vulcano Wela | |
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Percorso 4 | |
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Percorso 5 | |
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Percorso 7 | |
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Percorso 8 | |
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Percorso 8 | Giorno |
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Punta Akala | |
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Spiaggia Hanu Hanu | Giorno |
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Spiaggia Hanu Hanu | |
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Tunnel Diglett | |
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Viale Royale | Notte |
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Viale Royale | Giorno |
Ula Ula
| Immagine | Isola | Luogo |
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Percorso 10 | Giorno |
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Percorso 11 | Notte |
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Percorso 12 | |
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Percorso 12 | |
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Percorso 13 | |
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Percorso 13 | Notte |
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Percorso 14 | |
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Percorso 14 | Notte |
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Percorso 15 | |
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Percorso 16 | Giorno |
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Percorso 17 | |
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Percorso 17 | |
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Residenza Æther | Giorno |
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Monte Tepore | |
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Deserto Haina | |
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Osservatorio Hokulani | Notte |
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Malie – Promontorio di Malie | Giorno |
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Malie | Giorno |
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Malie – Centro Culturale | Notte |
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Giardini di Malie | |
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Monte Lanakila – Vetta | |
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Monte Lanakila – Primo spiazzo | |
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Poh | Giorno |
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Poh | Notte |
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Tempio del Raccolto | |
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Lido di Ula Ula | Giorno |
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Lido di Ula Ula | Notte |
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Villaggio Tapu | |
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Prato Ula Ula | |
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Prato Ula Ula |
Poni
| Immagine | Isola | Luogo |
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Via Antica di Poni | Giorno |
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Via Antica di Poni | |
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Via Antica di Poni | Notte |
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Scogliera di Poni | Giorno |
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Scogliera di Poni | Notte |
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Costa di Poni | |
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Costa di Poni | |
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Erta di Poni | |
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Erta di Poni | |
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Foresta di Poni | |
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Foresta di Poni | |
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Prato Poni | |
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Prateria di Poni | Giorno |
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Prateria di Poni | |
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Prateria di Poni | Notte |
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Piana di Poni | |
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Piana di Poni | Giorno |
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Piana di Poni | Notte |
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Caverna Climax | Giorno |
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Caverna Climax | |
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Caverna Climax | Notte |
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Tempio del Passaggio | |
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Villaggio del Mare | |
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Villaggio del Mare | |
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Canyon di Poni | |
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Canyon di Poni | |
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Canyon di Poni | |
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Canyon di Poni |
Æther Paradise
| Immagine | Luogo | Condizioni |
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Æther Paradise – P -2 | |
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Æther Paradise – Esterno | |
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Æther Paradise – Esterno | Giorno |
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Æther Paradise – Villa di Samina | |
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Æther Paradise – Esterno | Notte |